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mNGS及古细菌DNA检测应用推荐:PCR去污染试剂盒
发布时间:2021-07-15   点击次数:34次

描述

在研究和诊断中,PCR是一种检测DNA是否存在的敏感方法。PCR中使用的聚合酶经常被E.coli DNA污染。当检测少量细菌DNA时,污染的DNA可能导致灵敏度降低和假阳性。其他污染源可能是dNTPs、缓冲体系、引物/探针,以及操作过程中引入的DNA污染。一般来说,对细菌的检测和分型采用16S23S rDNA基因保守区段为靶点的广谱范围探针。该方法对细菌DNA污染非常敏感,而大多数Master mix和聚合酶中都发现细菌DNA的痕迹。当使用qPCR检测或定量少量的细菌DNA时,污染的E.coli DNA可能会导致假阳性结果。

 

为了解决这个问题,我们开发出PCR去污染试剂盒,既能去除Master mix中细菌DNA污染,又不影响PCR反应的灵敏度。此外,该试剂盒无RNase活性。


优势    

 1. 减少背景污染,提高目标基因检测下限;
     2. 不影响PCR检测灵敏度;
     3. 简单易用,操作方便。

 应用   1. 去除PCRRT-PCRmastermixE.coli内源DNA污染及其他DNA污染;
   2. 用于终点PCR和探针依赖的qPCR
   3. 用于细菌检测及基因分型;
   4. 用于古细菌DNA检测。

组分及特性

dsDNase:双链特异性DNA酶,去除Master mix、引物及探针等的污染DNA

DTT60℃条件下,能够不可逆灭活dsDNase,确保模板DNA不被清除。
不降低反应灵敏度   DNA污染是高灵敏度应用面对的主要问题。这些应用,以低丰度DNA为目标检测基因,极易受到污染DNA的干扰。因此,任何影响PCR灵敏度的去除DNA污染的方法,都是不能使用的。

Figure 2. PCR去污染试剂盒处理/未处理的mastermix510倍梯度稀释的gDNA和水(NTC)为模板进行qPCR检测。与NTC untreated组相比,NTC decontaminated组在45cycle仍然没有信号,说明PCR去污染试剂盒能程度去除mastermix中的污染。PCR去污染试剂盒处理前/后数据相比,Cq值并没有明显改变,说明基本不影响反应灵敏度。


订购信息

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     ArcticZymes Technologies成立于20世纪80年代后期,总部位于挪威。致力于从海洋生物中识别新的冷适应酶,用于分子研究、体外诊断和治疗领域。

    上海创凌生物科技有限公司,聚焦细胞治疗、基因治疗、类器官研究、mNGS病原微生物检测等领域,是ArcticZymes Technologies的中国代理。

 


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