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蛋白定量-Label-Free非标定量实验流程介绍
发布时间:2022-08-09   点击次数:64次


非标定量(Label-free)

非标记定量(label-free)蛋白质组学按其原理主要分为两种方法:1) Spectrum counts类的非标记定量方法:发展比较早,已经形成多种定量算法,但主要原理都是以MS2的鉴定结果为定量基础,各种方法的差别在于后期算法在大规模数据上的修正。 2) 以MS1为基础,计算每个肽段的信号强度在LC-MS色谱上的积分,Maxquant是现代高灵敏度质谱(High resolution of modern spectrometers)结果的分析软件,已经渐渐成为蛋白质组学领域内的标准解决方案之一。

实验流程

1. 蛋白提取和酶解

2. label free

3. 质朴分析

4. 蛋白定性定量

5. 生信分析

结果展示

实验周期及交付标准

1. 实验周期:6周左右

2. 交付标准:蛋白定量结果、鉴定结果、质谱原始数据、生信分析结果(GO分析、KEGG分析等等)

需确认的信息

1. 样本的种属

2. 样本的类型(组织or细胞or血液)

3. 样本的数量及分组

4. 分析要求


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